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常见细菌和其他微生物：
- 1.超过 50 组的链球菌菌株变体
- 2.幽门螺杆菌
- 3.大肠杆菌
- 4.沙门氏菌
- 5.食源性毒素（包括许多尚未被分类的微生物，即使通过烹饪杀死微生物体，微生物体本身仍然具有毒性，并可能在体内积聚）
- 6.耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 (MRSA)
- 7.艰难梭菌
- 8.葡萄球菌
- 9.霉菌
- 10.寄生虫
大多数微生物通过口腔进入，即通过食物、水、共享食物和饮料、受污染的餐具和刀叉、未经洗手进食或亲密接触。也有可能在浴室和餐馆感染链球菌或幽门螺杆菌等细菌。我们可以以感染病毒同样的方式感染细菌。
链球菌作为压力源
大多数人一生中体内存在不止一种链球菌菌株。在所有有害细菌中，链球菌是人类感染最多并在人体内最普遍存在的细菌。由于链球菌可能对抗生素产生耐药性，这导致其成为新的超级细菌。有些链球菌菌株会导致慢性疾病，让人生活很悲惨。一个人最终可能会感染多种类型的链球菌菌株，这些链球菌最终会在肝脏、肠道和其他器官中安营扎寨。链球菌给大脑带来压力的一种方式是引起病症，诸如严重的痤疮（青春痘）。痤疮对一个人来说可能是毁灭性的，因为这可以造成过度的情绪伤害。对于许多面部和身体上出现严重痤疮的人来说，这是一种创伤。
链球菌也对我们的大脑构成威胁，因为这会削弱免疫系统，让免疫系统变得不堪重负。通过削弱免疫系统，使得病毒得以大肆繁衍。链球菌和 EB病毒是共生伙伴，它们相互帮助。当链球菌削弱免疫系统时，EB病毒就会大肆繁衍，并造成大脑神经系统疾病。
某些类型的链球菌会引起高烧，高烧一次可能持续数天甚至数周。如果抗生素治疗无效，严重的链球菌性咽喉炎患者可能会出现38-40度的高烧，持续长达三个月。这种持续的发烧会烧毁糖原、神经递质和关键电解质储备，从而损害大脑并削弱中枢神经系统。
其他细菌和微生物也可以通过发烧来影响大脑。尽管发烧是身体有目的的自然反应，但持续几天的轻微发烧都会使大脑疲劳。这就是为什么发烧三四天的人在退烧后往往不会太有活力。受影响的不仅仅是身体，大脑也受到了影响。
好菌无法对抗坏菌
即使大量有益微生物也不会以任何方式改变我们肠道中坏菌的水平。例如一个人患有小肠细菌过度生长 (SIBO) ，或腹胀气，或肠易激综合征 (IBS)，有益菌群无法去除肠道内的链球菌。现在流行说法声称通过提升有益微生物（无论是通过流行产品还是发酵食品）创造肠道内的平衡，各类健康问题都会消失，这并不正确。因为理论的基石就是错的：有益细菌不会去除有害细菌，即进入肠道的有益细菌不会去除任何链球菌群或任何其他有害细菌诸如大肠杆菌。它们互不竞争，没有冲突。它们不吃同样的食物，不会互相开战。有益微生物不会攻击有害微生物，不会将其赶出其环境，不会让有害微生物去往某个地方，或消灭它。相反，我们需要通过食物和营养元素来去除链球菌等有害细菌，并且我们需要在此过程中重建我们的免疫系统。
“好菌对抗坏菌”理论被误导的另一个原因是：发酵食品和许多其他所谓“好”菌来源实际上并不含有有益细菌，反而含有有害细菌，这些细菌靠死亡的东西而不是活的东西而茁壮成长。益生菌、各类饮料、粉末、片剂或抗念珠菌方案无法帮助疗愈，因为缺乏对问题根本原因的理解，没有人知道链球菌是肠道环境中导致小肠细菌过度生长等问题的主要细菌，发酵食品和益生菌无法杀死或阻止链球菌。
食物中毒
食物中毒的危害比我们想象的要严重。不仅因为这可能引发发烧或胃部不适、腹泻或呕吐，还因为微生物会对大脑造成影响。当一个人食物中毒时，可能会失去对头脑和思想的控制，不知道自己在哪里，出现复视，在某些情况下甚至产生幻觉，这种情况并不少见。这是因为食物中毒背后的活跃细菌、寄生虫和其他微生物会生成有毒排泄物，对大脑造成很大的问题和伤害；当这些毒素通过血液进入大脑时，就会产生致幻作用。
这些食源性微生物（如寄生虫和细菌）产生的毒素不是神经毒素，与病毒产生病毒神经毒素的方式不同。这些细菌和寄生虫毒素不会像病毒神经毒素那样伤害大脑。食源性病原体具有不同的毒性水平，无论是活着的形式还是煮熟的形式，随尸体一起释放和排泄。这种毒性会引发身体和大脑的急性过敏反应，表现为呕吐、腹泻和疼痛。这最终会变成神经性问题，因为一旦身体开始出现过敏反应，大脑就会产生过敏反应，因为大脑检测到了正在发生的威胁：器官可能会停止运作，所以身体和大脑都会进入危机模式。
不同的微生物会产生不同的作用。例如，危险的大肠杆菌可以很快侵蚀肠道内壁，造成内部伤口。与此同时，一种在实验室中从未被识别或研究过的微生物位于一块生鱼片上，可能不会吃掉肠道内壁，但可能释放出一种毒素，肠道会强烈地试图排出这种毒素，体内的细胞由于中毒，而对毒素产生反应，这成为过敏反应。如果这些毒素最终通过血液进入大脑或穿过血脑屏障，大脑就会表现出过敏反应，产生幻觉、癫痫发作和食物中毒可能出现的其他症状。
即使将一块含有活着的沙门氏菌、大肠杆菌或数千种其他微生物的生肉或鸡肉彻底煮熟使得细菌死亡，这些微生物尸体仍然具有毒性。大多数时候，一个人感觉不到这些微生物的影响。但在某些情况下，大脑会对有毒微生物尸体过敏，引发呕吐等剧烈反应，或失去功能处于近乎瘫痪的状态。
大脑的任何部分都容易受到微生物、微生物毒素或微生物尸体的影响。有些微生物毒素不会影响大脑的某些区域，但会影响其他区域。一些有毒微生物会影响整个大脑。有些寄生虫会分泌有毒物质，影响大脑的任何部位。各不相同，每个人食物中毒表现和严重程度也会因此而有所差异。
有如此多尚未被发现、未被研究、未被分析的微生物，食物和水中有数千种我们不知道的微生物，它们对大脑的有害影响包括发烧、癫痫、幻觉、剧烈颤抖、视力模糊、视力丧失、头部和颈部明显疼痛、喉咙发紧、吞咽困难，这些都是对大脑和身体影响的组合。通常，并不是微生物本身进入大脑，而是微生物毒素进入了大脑。
不过极端反应一般较为罕见，一般人们每天在吃下有害微生物后并不知道为什么他们会出现荨麻疹、感到恶心和呕吐。在这种情况下，医生经常将其认为是24 小时流感，实际上这是因为他们在某处吃了某些东西后的食物中毒。
寄生虫引起的食物中毒会削弱免疫系统，引发体内病毒大肆繁衍，从而触发在体内的病毒症状，导致慢性疾病。这些症状很容易被误认为是寄生虫引起的，因为这是在食物中毒后出现的。实际上寄生虫无法在人体内长期生存和繁殖，持久的症状来自被触发的病毒。蠕虫不是寄生虫。几乎所有蠕虫都可以生活在我们体内，并且不会造成慢性疾病。
